Kapsul lunak dapat diisi dengan berbagai minyak atau obat cair atau suspensi yang tidak melarutkan gelatin, atau dapat diisi dengan obat padat. Isi cairan dapat dibagi menjadi tiga kategori:
(1) Cairan yang mudah menguap atau tidak-mudah menguap dan tidak dapat bercampur dengan air, seperti minyak nabati atau minyak aromatik.
(2) Cairan non-volatil yang dapat larut dengan air, seperti polietilen glikol dan surfaktan nonionik.
(3) Senyawa yang dapat larut dengan air tetapi volatilitasnya rendah, seperti gliserol, propilen glikol, dan isopropanol.
Obat sering kali menyerap air, yang dapat mengubah kadar air di dalam cangkang kapsul lunak. Jika obat bersifat hidrofilik, obat tersebut harus menahan 5% air. Minyak umumnya digunakan sebagai pelarut atau media suspensi obat. Meskipun kapsul lunak berisi minyak-tidak mengandung air, uap air atau air dari cangkang dapat menembus dinding kapsul. Jika obat bersifat hidrofilik, obat tersebut harus menahan 3% air. Jika obat cair mengandung lebih dari 50% air atau mengandung pelarut mudah menguap dengan berat molekul rendah yang dapat larut dengan air, seperti etanol, aseton, amina, asam, dan ester, maka kapsul lunak dapat melunakkan atau melarutkan. Oleh karena itu, tidak cocok untuk membuat kapsul lunak. Saat mengisi obat cair, pH harus dikontrol antara 2,5 dan 7,5. Jika tidak, kapsul lunak dapat bocor selama penyimpanan karena hidrolisis asam gelatin. Alkalinitas yang kuat dapat mengubah sifat gelatin dan mempengaruhi kelarutan kapsul lunak. Kandungan zat besi dalam bahan baku gelatin kapsul lunak tidak boleh melebihi 0,0015% untuk menghindari kerusakan obat yang sensitif terhadap zat besi.